Der DFB hat die Spieltage 35 bis 38 in der 3. Liga zeitgenau angesetzt. Damit stehen alle Spieltermine bis Saisonende fest. Abgeschlossen wird die Spielzeit 2019/2020 am Samstag, 4. Juli 2020.
Das Münchner Derby findet am Mittwoch, 24. Juni 2020 um 20.30 Uhr unter Flutlicht an der Grünwalder Straße statt. An gleicher Stelle treffen nur drei Tage danach die Löwen und die SpVgg Unterhaching zum nächsten Nachbarschaftsduell aufeinander. Anpfiff am Samstag, 27. Juni 2020 ist um 14 Uhr.
An den letzten beiden Spieltagen der Saison werden die jeweiligen Partien wie gewohnt alle zeitgleich ausgetragen. Dabei geht es für 1860 München zuerst nach Großaspach, wo am Mittwoch, 1. Juli 2020 um 18.60 Uhr angestoßen wird. Der letzte Spieltag der Saison findet am 4. Juli 2020 statt, um 14 Uhr erwarten die Löwen den FC Ingolstadt 04.
Die beiden bestplatzierten Mannschaften (mit Ausnahme des FC Bayern II) sind sportlich aufstiegsberechtigt, der Tabellendritte geht in die Relegation gegen den Tabellen-16. der 2. Bundesliga. Die ersten vier der 3. Liga sind darüber hinaus für den DFB-Pokal 2020/2021 qualifiziert, wobei auch hier gilt, dass zweite Mannschaften nicht startberechtigt sind und der nächstplatzierte Klub entsprechend nachrücken würde. Die vier letzten Teams in der Abschlusstabelle steigen in die Regionalliga ab.